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FPGA在实时基因组测序计算大显身手,把测序时间从30小时缩短到26分钟!

基因组测序是一种新型基因检测技术,它可以从血液或者唾液中分析测定基因全序列,用来预测疾病,个人的行为特征等等。实现这一项技术需要海量的计算支持,常常需要等待一段时间才可以获得检测结果。然而,Edico Genome推出的“龙”硬件加速卡将测序计算时间由30小时缩短到26分钟,很快就可能优化实现实时计算的目标。

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IBM Power Systems最近在《华盛顿邮报》官网上发表了题为“Powerful computing crunches genomic data at warp speed”的文章,文章描述了Edico Genome使用硬件加速器来加速基因研究的海量计算。Edico Genome董事长兼CEO Pieter van Rooyen和他的团队在南非进行血液分析的工作,主要面向两种疾病:艾滋病(HIV)和肺结核(tuberculosis)。同时他们也开发了一款定制的硬件加速卡来加速计算,这款加速卡就是“龙”卡,卡上集成了基于IBM Power8处理器的S822LC高性能计算服务器和Xilinx 28nm FPGA。

加速卡计算的效果如何呢?“之前一个基因组测序需要大约30小时” van Rooyen说,“我们已经把计算时间降到26分钟,很快,我们就会进一步优化到10分钟”。他预计一个全序列基因编译可以在接近实时的时间内完成。

Xilinx芯片今日搜索排行榜(2026/10/2)
XC7K325T-L2FB900E
FPGA现场可编程门阵列
900-FCBGA
XC7Z100-L2FFG900I
集成电路(IC) > 嵌入式 > 片上系统(SoC)
封装:900-FCBGA(31x31)
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集成电路(IC) > 嵌入式 > CPLD(复杂可编程逻辑器件)
封装:64-VQFP(10x10)
XC2S150-5PQG208C
集成电路(IC) > 嵌入式 > FPGA(现场可编程门阵列)
封装:208-PQFP(28x28)
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FPGA现场可编程门阵列
324-CSPBGA
XC7K325T-1FFG676I
集成电路(IC) > 嵌入式 > FPGA(现场可编程门阵列)
封装:676-FCBGA(27x27)
XA6SLX75-2FGG484I
嵌入式 - FPGA(现场可编程门阵列)
产品封装:484-BBGA
LFE2-35E-6F484C
集成电路(IC) > 嵌入式 > FPGA(现场可编程门阵列)
封装:484-FPBGA(23x23)
M5LV-256/68-12YI
集成电路(IC) > 嵌入式 > CPLD(复杂可编程逻辑器件)
封装:100-PQFP(14x20)
M4A3-256/128-10FANI
集成电路(IC) > 嵌入式 > CPLD(复杂可编程逻辑器件)
封装:256-FPBGA(17x17)
LFXP2-30E-7FN672C
集成电路(IC) > 嵌入式 > FPGA(现场可编程门阵列)
封装:672-FPBGA(27x27)
1SG280HU3F50E2LGS3
集成电路(IC) > 嵌入式 > FPGA(现场可编程门阵列)
封装:2397-FBGA,FC(50x50)
5ASTFD5G3F35I5N
嵌入式片上系统芯片
1152-FBGA
1SG250HN1F43I2VG
集成电路(IC) > 嵌入式 > FPGA(现场可编程门阵列)
封装:1760-FBGA(42.5x42.5)
5SGXMB6R3F40I3G
集成电路(IC) > 嵌入式 > FPGA(现场可编程门阵列)
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